Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cited1P97769 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cited1P97769 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited1P97769 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited1P97769 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms