Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smyd1P97443 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smyd1P97443 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms