Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhodP97348 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhodP97348 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhodP97348 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhodP97348 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhodP97348 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhodP97348 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhodP97348 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhodP97348 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhodP97348 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhodP97348 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhodP97348 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhodP97348 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RhodP97348 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhodP97348 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RhodP97348 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RhodP97348 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhodP97348 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhodP97348 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RhodP97348 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhodP97348 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RhodP97348 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RhodP97348 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms