Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43cP86449 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43cP86449 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43cP86449 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms