Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx1P81068 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx1P81068 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms