Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb6P70689 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb6P70689 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb6P70689 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms