Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp4P70343 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp4P70343 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp4P70343 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp4P70343 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp4P70343 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp4P70343 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp4P70343 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms