Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad1P70340 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad1P70340 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad1P70340 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad1P70340 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad1P70340 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad1P70340 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad1P70340 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad1P70340 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad1P70340 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad1P70340 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smad1P70340 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad1P70340 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smad1P70340 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad1P70340 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad1P70340 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smad1P70340 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad1P70340 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms