Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pitx1P70314 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pitx1P70314 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms