Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DccP70211 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DccP70211 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DccP70211 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DccP70211 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
DccP70211 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DccP70211 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DccP70211 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DccP70211 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DccP70211 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DccP70211 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DccP70211 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DccP70211 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DccP70211 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DccP70211 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DccP70211 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DccP70211 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DccP70211 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DccP70211 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DccP70211 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DccP70211 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DccP70211 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DccP70211 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DccP70211 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DccP70211 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DccP70211 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DccP70211 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DccP70211 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DccP70211 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DccP70211 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DccP70211 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DccP70211 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DccP70211 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DccP70211 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DccP70211 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DccP70211 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DccP70211 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DccP70211 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DccP70211 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DccP70211 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms