Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crip1P63254 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms