Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2lP62876 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2lP62876 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr2lP62876 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms