Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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