Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2kP61087 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2kP61087 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms