Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia3P60469 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms