Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sash1P59808 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sash1P59808 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sash1P59808 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sash1P59808 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sash1P59808 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sash1P59808 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sash1P59808 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sash1P59808 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sash1P59808 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms