Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rin3P59729 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms