Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr8P58682 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr8P58682 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr8P58682 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms