Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd4P58467 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Setd4P58467 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd4P58467 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd4P58467 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms