Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn4P57780 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actn4P57780 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn4P57780 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn4P57780 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn4P57780 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn4P57780 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms