Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms