Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faf1P54731 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Faf1P54731 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Faf1P54731 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Faf1P54731 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms