Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolgP54099 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolgP54099 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolgP54099 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolgP54099 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolgP54099 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolgP54099 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolgP54099 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolgP54099 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolgP54099 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolgP54099 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolgP54099 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolgP54099 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PolgP54099 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PolgP54099 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PolgP54099 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PolgP54099 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PolgP54099 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolgP54099 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PolgP54099 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PolgP54099 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolgP54099 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolgP54099 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PolgP54099 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PolgP54099 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms