Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab2aP53994 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab2aP53994 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms