Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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