Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ClgnP52194 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ClgnP52194 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ClgnP52194 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClgnP52194 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms