Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XpcP51612 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XpcP51612 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XpcP51612 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XpcP51612 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XpcP51612 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XpcP51612 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XpcP51612 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XpcP51612 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XpcP51612 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XpcP51612 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XpcP51612 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XpcP51612 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XpcP51612 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XpcP51612 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XpcP51612 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XpcP51612 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XpcP51612 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XpcP51612 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XpcP51612 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XpcP51612 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XpcP51612 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XpcP51612 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XpcP51612 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XpcP51612 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XpcP51612 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XpcP51612 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XpcP51612 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XpcP51612 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XpcP51612 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XpcP51612 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XpcP51612 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XpcP51612 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XpcP51612 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XpcP51612 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XpcP51612 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XpcP51612 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XpcP51612 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XpcP51612 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XpcP51612 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XpcP51612 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XpcP51612 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XpcP51612 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XpcP51612 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XpcP51612 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XpcP51612 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XpcP51612 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XpcP51612 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XpcP51612 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XpcP51612 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XpcP51612 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XpcP51612 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms