Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf10P50592 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf10P50592 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfsf10P50592 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf10P50592 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms