Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TubP50586 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TubP50586 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TubP50586 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TubP50586 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TubP50586 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TubP50586 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TubP50586 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TubP50586 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TubP50586 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TubP50586 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TubP50586 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TubP50586 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TubP50586 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TubP50586 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TubP50586 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TubP50586 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TubP50586 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TubP50586 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TubP50586 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TubP50586 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TubP50586 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TubP50586 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TubP50586 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TubP50586 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TubP50586 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TubP50586 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TubP50586 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TubP50586 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TubP50586 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TubP50586 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TubP50586 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TubP50586 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TubP50586 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TubP50586 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TubP50586 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TubP50586 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TubP50586 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms