Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LtbrP50284 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LtbrP50284 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LtbrP50284 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms