Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc13P50207 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc13P50207 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms