Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cav1P49817 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cav1P49817 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms