Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LmnaP48678 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LmnaP48678 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LmnaP48678 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms