Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcd1P48410 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms