Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpiaP47968 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpiaP47968 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RpiaP47968 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RpiaP47968 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms