Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3aP47708 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rph3aP47708 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rph3aP47708 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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