Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt1P46096 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syt1P46096 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Syt1P46096 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syt1P46096 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syt1P46096 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syt1P46096 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syt1P46096 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms