Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc1P34928 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc1P34928 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms