Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd1P33215 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd1P33215 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms