Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh15P33146 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh15P33146 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh15P33146 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms