Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnd3P30282 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnd3P30282 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnd3P30282 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms