Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1P29341 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pabpc1P29341 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc1P29341 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms