Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TbpP29037 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TbpP29037 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TbpP29037 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbpP29037 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbpP29037 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbpP29037 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbpP29037 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TbpP29037 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TbpP29037 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms