Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxd10P28359 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxd10P28359 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd10P28359 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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