Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd9P28357 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd9P28357 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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