Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mgat1P27808 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mgat1P27808 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms