Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CenpbP27790 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CenpbP27790 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CenpbP27790 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms