Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NdnP25233 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NdnP25233 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NdnP25233 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NdnP25233 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NdnP25233 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NdnP25233 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NdnP25233 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NdnP25233 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NdnP25233 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NdnP25233 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NdnP25233 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NdnP25233 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NdnP25233 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NdnP25233 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NdnP25233 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms