Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria2P23819 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria2P23819 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria2P23819 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gria2P23819 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria2P23819 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria2P23819 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria2P23819 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gria2P23819 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gria2P23819 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gria2P23819 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gria2P23819 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gria2P23819 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms