Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf8P23611 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf8P23611 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf8P23611 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf8P23611 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf8P23611 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.1 ms